CF-5200 よくあるご質問

設定回数は周波数分析したデータを1データとし、平均したいデータ数（＝分析回数）を意味します。

時間設定は平均したい時間に達するまで平均回数を重ねることを意味します。

周波数分析1回とは初期設定はデータ長（サンプリング数）2048になっていますが、このデータから1回FFT（周波数分析）します。
演算の後ろではデータは絶えずサンプリングしています。
FFT演算が終わると、その時点から2048さかのぼったデータで次のFFTを実行します。よって前のデータの一部を使っている状態になりこれをオーバラップ処理といいます。
オーバラップしている量は周波数レンジで変わりますので時間平均の場合、何回の平均回数になるか一度測定しないと不明です。

関連する取扱説明書の章

5.1.3.（3）加算平均
3.12オーバラップ量の設定